Кафедра образована в сентябре 1982 года и носила название «Детские болезни №3» до 1996 года. 1996-2000 годы – «Врач общей практики (ВОП). 2000-2008 годы – «Госпитальная Педиатрия №2». С 2008 по настоящее время – « Госпитальная педиатрия №2 с народной медициной».
Первым заведующим кафедрой был утвержден кандидат медицинских наук, доцент Ким Алексей Александрович . Согласно штатному расписанию, 1982 /1983 учебный год первый коллектив кафедры начал в следующим составе:
1. Ким А.А – заведующий кафедрой, к.м.н., доцент.
2. Кенджебаев С.Ш. – к.м.н., доцент.
3. Мусаев Ю.М. - к.м.н., доцент.
4. Касымова С.Б. - к.м.н., ассистент
5. Лютая З.А. - к.м.н., ассистент
6. Атаджанова Ф.Н. - к.м.н., ассистент
7. Каримова М.Н. - к.м.н., ассистент
8. Алтыбаева С.Ш. - к.м.н., ассистент
9. Алиева М.М. - к.м.н., ассистент
10. Игнатова О.Ф. – ассистент
11. Скирневская А.И. - ассистент
12. Калюжная С.И. – ассистент
13. Валиева Ф.Т. - ассистент
14. Бондаренко Н.Ф. - ассистент
15. Алиева Л.Д. - ассистент
16. Септимов Д.Е. – ассистент
17. Исмаилова М.А. - ассистент
18. Попова Н.В. – клинический ординатор
19. Ли Л.Л. - клинический ординатор
20. Нагай Л.Л. - клинический ординатор
21. Кадырова Ш.Ш. - клинический ординатор
22. Мамунцева Э.А. - клинический ординатор
23. Черникова А.А. – старший лаборант
24. Нишанбаев Р.Т. - старший лаборант.
Кафедра располагалось на базе городской многопрофильной больницы (160 коек) массива Юнус - Абад, 10ой детской объединенной больнице (110 коек) Чиланзарского района, детской поликлинике №5 Кировского района и 10 детской поликлинике Чиланзарского района города Ташкента.
В период с 1986 года по 1992 годы кафедру возглавляла доктор медицинских наук, профессор Иванова Надежда Васильевна, 1936 года рождения, русская, педиатр. Иванова Надежда Васильевна окончила ТашГосМИ в 1960 году. В 1960-1966 годах преподавала в медицинском училище. В 1966-1972 годах врач ординатор 15ой городской клинической больницы. С 1972 года по 1986 годы прошла путь от клинического ординатора, ассистента, доцента различных педиатрических кафедр ТашПМИ, с 1986 года возглавила кафедру «Детские болезни №3» совмещая должность проректора по науке института. В 1989 году защитила докторскую диссертацию на тему: «Нарушение центральной и периферической гемодинамики при наиболее распространенных заболеваниях детского возраста в прогнозировании сердечно - сосудистой патологии».
С 1992 года кафедру возглавляет доктор медицинских наук, профессор Рахимов Саидолим Анварович, 1952 года рождения, узбек, педиатр, ревматолог. Рахимов Саидолим Анварович окончил Среднеазиатский Медицинский Педиатрический институт в 1975 году. В 1975-1977 годах проходил клиническую ординатуру на кафедре факультетской педиатрии института. В 1977-1979 годах служил в Советской Армии. В период с 1979 по 1982 годах обучался в очной аспирантуре данной кафедры. С 1982 года по 1990 годы – ассистент, с 1990 года по 1995 годы доцент, с 1995 года – профессор. В 1994 году им защищена докторская диссертация на тему: « Клиническая интерпретация результатов в генеалогии и ассоциаций ювенильного хронического артрита с некоторыми менделирующими и неменделирующей маркерными системами в условиях эффекта выщепления инбридинга». Одновременно с заведованием кафедры в 1993-1997 годах являлся ответственным секретарем приемной комиссии. 1993-1994 годы – главный педиатр Министерство Здравоохранения Республики. 1996-1998 года декан факультета, 2001-2002 годы директор Республиканского Перинатального центра, 1997-2005 года – ученый секретарь Специализированного Совета по педиатрии, с 1996 года по настоящее время член редколлегии журнала «Педиатрия». В 2010 году под редакцией профессора Рахимова С.А. издан учебник «Госпитальная педиатрия» на государственном языке (латиница, кириллица).
В настоящее время заведующей кафедрой является д.м.н., профессор Ахмедова Дилором Илхамовна. Под руководством Д.А.Ахмедовой защищены 5 докторских и более 20 кандидатских диссертаций.
Кафедра успешно сочетала научную работу с учебно-методической работой. Заслуги многих сотрудников кафедры не однократно отмечались руководством института МЗ и Минвуза. Сотрудники кафедры активно участвуют в разработке методических рекомендаций, учебных пособий и учебников по пропедевтике детских болезней и по общему уходу за детьми. Усилиями сотрудников кафедры выпущено более 20 методических рекомендаций, 2 учебника и учебных пособий, монографии.