Основные направления деятельности отдела:
•    Повысить научный потенциал ППС и кафедр института;
•    Повысить показателей активной интеграции медицинской науки нашей страны с мировой наукой;
•    Внедрение результатов научных исследований в практику;
•    Подготовка высококвалифицированных научных и научно-педагогических кадров, а также всесторонняя поддержка научного творчества молодёжи;
•    Выявление студентов (СНО) и создание методических, педагогических и психологических условий для их подготовки;
•    Введение мониторинга старших научных сотрудников – соискателей в целях обеспечения выполнения Государственной программы по подготовке кадров;

Организационные и другие задачи отдела:
•    Обеспечение оттисками печатных изданий результатов научно-исследовательских работ кафедр и отдела;
•    Принятие отчета кафедры по  научно-исследовательским работам и его анализ, рассмотрение на Ученом Совете.
•    Введение мониторинга государственных грантов, осуществление сдачи в намеченный срок годовых отчётов.
•    Организация и проведение приёма старших научных сотрудников и стажеров – соискателей по Уставу;
•    Анализ отчетов Проблемных комиссий и устранение недостатков;
•    Проверка первичного материала по научно исследовательским результатом диссертации;
•    Совместное рассмотрение диссертационных работ на Проблемных и апробационных советах до защиты;
•    Организация и проведение полугодовых и годовых аттестаций старших научных – сотрудников по уставу;
•    Ведение мониторинга внедрения результатов исследований в учебно – образовательный процесс;
•    Регулярный ответ на приказы, распоряжения и модемограммы  министерства Высшего и средне-специального образования, Министерства Здравоохранения.

При отделе подготовки научных и научно - педагогических кадров действуют:
1. Студенческое научное общество
2. Проблемные Советы (медико-биологический и хирургический).
3. Апробационный совет.