Toshkent Pediatriya Tibbiyot Institutida magistratura bo’limi 2000-2001 o’quv yilida tashkil topgan. Bo’limning birinchi raxbari bo’lib professor Fayziev Xamid Nishanovich. tayinlangan. Uch yo’nalish bo’yicha magistraturaga 15 talaba qabul qilingan. 2001-2002 o’quv yilida 4 mutaxassistlik bo’yicha 33 talaba qabul qilingan.

2002-2003 o’quv yilida magistratura bo’limiga dotsent Nosirov Abdusattor Axadovich boshliq etib tayinlangan. Shu o’quv yilida 8 yo’nalish bo’yicha 61 talaba qabul qilingan .

2003-2004 o’quv yilida 9 ta mutaxassislik bo`yicha 55 ta magistr kabul kilingan.

2004-2005 o’quv yilida 14 ta mutaxassislik bo`yicha 90 ta magistr qabul qilingan.

2005-2006 o’quv yilida magistratura bo’limiga dotsent Agzamov Anvar Mirafzalovich. boshliq etib tayinlangan, 21 ta mutaxassislik bo`yicha 152 ta magistr qabul qilingan.

2006-2007 o’quv yilida 21 ta mutaxassislik bo`yicha 131 ta magistr qabul qilingan

2007-2008 o’quv yilida 22 ta mutaxassislik bo`yicha 136 ta magistr qabul qilingan.

2008-2009 o’quv yilida 22 ta mutaxassislik bo`yicha 94 ta magistr qabul qilingan.

2009-2010 o’quv yilida 22 ta mutaxassislik bo`yicha 102 ta magistr qabul qilingan.

2010-2011-o’quv yilida 23 mutaxassislikka 124 magistr qabul qilingan

2011-2012 o’quv yilida 21 mutaxassislikka 151ta talaba qabul qilingan.

2012-2013 o’quv yilida 24 mutaxassislikka 151ta talaba qabul qilingan.

2013 yildan 2014 yilgacha bo`limni T.f.d., dotsent Qaxramon Najmiddinovich Xaitov boshqargan.

2013-2014 o’quv yilida 24 mutaxassislikka 151ta talaba qabul qilingan.

2014 yildan 2016 yilgacha bo`limni T.f.n., dotsent Valiev Abdusamad Razzakovich boshqargan.

2014-2015 o’quv yilida 24 mutaxassislikka 151ta talaba qabul qilingan.

2015-2016 o’quv yilida 24 mutaxassislikka 151ta talaba qabul qilingan.

2016 yildan bo`limni t.f.n., dotsent Raxmatullaev Akmal Abadbekovich boshqarib kelmoqda.

Bo’lim ochilganidan beri shu paytgacha  1200 dan ortiqmagistr tayyorlangan.