Toshkent pediatriya tibbiyot instituti Buhgalteriya hisobi va tоvar moddiy boyliklar bo’limi, institut Nizomiga asosan ish faoliyat yuritadi hamda o’zining amaliy ishida rektorning buyruq va topshiriqlariga rioya qiladi. Institut maxsus mablag’lar harajatlar smetasiga kirim va chiqimlarni, boshqa nobyudjet mablag’lar bo’yicha hisobotni olib boradi. Professor-o’qituvchi, ishchi-hodimlarga ish haqini, talabalarga stipendiyani va nafaqalarni o’z vaqtida to’g’ri hisoblash hamda to’lovni amalga oshiradi.